目的探讨蕲蛇酶注射液对基底节区脑梗死患者血清髓鞘碱性蛋白（MBP）和凝血酶的影响。方法选取2014年2月至2015年12月我院收治的基底节区脑梗死患者86例为研究对象，根据患者就诊编号奇偶顺序分为常规组和干预组，每组43例。常规组患者采用常规方法治疗，干预组患者在常规组治疗基础上加用蕲蛇酶注射液治疗，比较两组患者的治疗效果及治疗前后血清MBP、凝血酶水平。结果干预组患者治疗总有效率为97.68%，常规组为83.72%，干预组患者临床疗效显著优于对照组（P＜0.01）。治疗前两组患者血清MBP、凝血酶水平比较差异无统计学意义（P＞0.05）；治疗后干预组患者血清MBP、凝血酶水平均显著低于常规组（P＜0.05）。结论在常规治疗的基础上，加用蕲蛇酶注射液治疗基底节区脑梗死患者，可显著降低其血清MBP和凝血酶水平，改善病灶血液循环，促进脑组织和神经功能恢复，显著提高临床治疗效果。