目的分析重症手足口病患儿的病原学、临床及磁共振成像（MRI）等特征，提高诊治水平。方法对收治的重症手足口病合并脊髓炎、脑炎患儿32例的临床资料进行回顾性分析。结果32例患儿中，EV71核酸阳性20例（62.5%）；柯萨奇病毒A16型（Cox A16）核酸阳性8例（25.0%），检出非肠道病毒4例（12.5%）。患儿临床上除表现为发热，口腔、手、足部位丘疹、斑丘疹外，还会出现精神差、易惊、嗜睡、肢体抖动以及肢体瘫痪等神经系统症状；部分患儿MRI检查显示脊髓炎、脑炎改变。结论重症手足口病合并脊髓炎、脑炎患儿年龄多在4个月至4岁，EV71为其主要病原体，可引起患儿单侧或双侧肢体瘫痪。MRI检查安全、无创，对手足口病合并脊髓炎、脑炎的正确诊断和鉴别诊断有重要意义。