目的探讨对未经核苷（酸）类似物治疗的慢性乙型肝炎患者进行预存耐药检测并根据检测结果选择药物进行治疗对患者临床治疗效果的影响，分析预存耐药检测对抗病毒治疗方案选择的意义。方法选择清远市人民医院感染科2016年7～12月未经核苷（酸）类似物治疗的慢性乙肝患者400例，按照随机数字表法将患者分为两组，每组200例。观察组患者在治疗前进行预存耐药基因检测，根据预存耐药检测结果选择合适核苷类似物（NAs）治疗；对照组不进行耐药检测，依患者意愿选择药物进行治疗，疗程48周。检测比较两组患者的HBeAg阴转率、HBeAg血清学转换率、HBV-DNA转阴率、ALT复常率、耐药率及血清HBV-DNA定量情况。结果治疗36周和48周后，观察组患者的HBeAg阴转率及HBeAg血清学转换率显著高于对照组患者(P＜0.05)；治疗24周、36周、48周后，观察组患者的HBV-DNA转阴率和血清ALT复常率均显著高于对照组(P＜0.05)。治疗前两组患者的血清HBV-DNA定量比较差异无统计学意义(P＞0.05)，治疗12周、24周、36周、48周后观察组患者血清HBV-DNA定量显著低于对照组 (P＜0.05)；治疗12周、24周、36周、48周后观察组患者的耐药率均显著低于对照组(P＜0.05)。结论乙型肝炎患者抗病毒治疗前进行预存耐药基因检测并根据检测结果选择药物进行治疗，可显著提高抗病毒治疗应答，减少原发耐药的发生，提高患者的临床治疗效果，对有效防控慢性乙型肝炎的流行具有重要意义。